百年探索、勇攀高峰，同济医院的科研业绩是我国医学界的一道亮丽风景线，被业内誉称为“同济现象”。主持国家重点研发计划10项；获得国家自然科学基金项目数连续9年突破百项，名列全国医院前茅。所承担的国家级科研课题数名列全国医院前茅。获得科研课题成果奖达560项次，其中11项成果荣获国家级科技进步二等奖、发明奖和自然科学二等奖。科研论文发表数位居全国医疗机构前列，中国科学技术信息研究所发布统计显示，医院2018年国际顶级期刊发表研究论文数量在全国医疗机构中排名第2位。医院重视科研成果转化，支持以产学研联合形式，开展转化医学和转化药学研究。